Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms