Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUR3

Foxj3, Forkhead box protein J3, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj3Q8BUR3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxj3Q8BUR3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxj3Q8BUR3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms