Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup54Q8BTS4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms