Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbrm1Q8BSQ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbrm1Q8BSQ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms