Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap4Q8BMK4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms