Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy1Q8BIJ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy1Q8BIJ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms