Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms