Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms