Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SynprQ8BGN8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynprQ8BGN8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms