Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms