Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sv2bQ8BG39 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms