Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.5Q85ZW7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.5Q85ZW7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms