Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4cQ811C2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg4cQ811C2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Atg4cQ811C2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Atg4cQ811C2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Atg4cQ811C2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Atg4cQ811C2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Atg4cQ811C2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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