Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NfascQ810U3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms