Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Liat1Q810M6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms