Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms