Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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