Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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