Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc28Q80XJ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc28Q80XJ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc28Q80XJ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc28Q80XJ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms