Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrde2Q80XC6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms