Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hapln4Q80WM4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms