Protein–RNA interactions for Protein: Q80WC9

Aasdh, Acyl-CoA synthetase family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AasdhQ80WC9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AasdhQ80WC9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AasdhQ80WC9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms