Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf4Q80VU4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf4Q80VU4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms