Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll4Q80V24 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll4Q80V24 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms