Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80UB0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80UB0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q80UB0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q80UB0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q80UB0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q80UB0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q80UB0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q80UB0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q80UB0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q80UB0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q80UB0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms