Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms