Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp3Q7TST5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms