Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp6r1Q7TSI3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp6r1Q7TSI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp6r1Q7TSI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp6r1Q7TSI3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp6r1Q7TSI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp6r1Q7TSI3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp6r1Q7TSI3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms