Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms