Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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