Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphp3Q7TNH6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms