Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms