Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HhipQ7TN16 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HhipQ7TN16 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms