Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim12Q78RX3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim12Q78RX3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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