Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Higd1cQ76I25 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms