Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SynmQ70IV5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SynmQ70IV5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms