Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RfflQ6ZQM0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RfflQ6ZQM0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms