Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp34Q6ZQ93 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp34Q6ZQ93 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms