Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm3bQ6ZPY7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms