Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smpd4Q6ZPR5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms