Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Opn5Q6VZZ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn5Q6VZZ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms