Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift172Q6VH22 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms