Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Ccdc88cQ6VGS5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
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Ccdc88cQ6VGS5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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