Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd300lfQ6SJQ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd300lfQ6SJQ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms