Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ptx4Q6RUU0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms