Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med16Q6PGF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med16Q6PGF3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms