Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HjurpQ6PG16 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HjurpQ6PG16 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HjurpQ6PG16 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HjurpQ6PG16 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HjurpQ6PG16 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HjurpQ6PG16 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HjurpQ6PG16 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms