Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc82Q6PG04 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms