Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85bQ6PDY0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms