Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms